Pimpinan universitas adalah Rektor dan para Wakil Rektor, bertugas antara lain menjalankan fungsi pengelolaan universitas secara keseluruhan, melaksanakan penyelenggaraan pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada kepada masyarakat, membina sivitas akademika (dosen & mahasiswa) serta membina hubungan dengan alumni, baik di lingkungan universitas dan masyarakat. Rektor diangkat/diberhentikan oleh Pimpinan Yayasan Al Barakah Abepura untuk Masa Jabatan 5 (lima) tahun, setelah melalui proses pemilihan yang diadakan khusus dalam suatu rapat terbuka oleh Pimpinan Yayasan Al Barakah. Berikut ini adalah susunan Pimpinan Universitas Papua Madani Jayapura periode 2021-2026:
Dr. Syarifuddin, S.E., M.Si
Alamat: Perumahan Dosen USTJ Abepura Kota Jayapura
No.Telp: +62 813-4417-0171
Drs. H. Syamsuddin, M.M. | Drs. H. Burhanuddin, M.Si. | Dra. Hj. Darmiati, M.Pd. |
Wakil Rektor Bidang Riset dan Kerjasama Alamat: No.Telp +62 853-5732-4252 | Wakil Rektor Bidang Bisnis dan Komunikasi Alamat: No.Telp +62 813-4458-5024 | Wakil Rektor Bidang Akademik dan Kemahasiswaaan Alamat: No.Telp +62 813-4410-3525 |